高新专项莆田审计条件中特别要注意的几个方面包括：

　　关注单位时间段高新技术产品（服务）收入的变化情况：分析变化趋势是否正常，是否涉及重大的关联方交易，是否符合申报企业的经营规律（如季节性、周期性等）。

　　关注高新技术企业技术性收入：特别是当期开始的，提供劳务、跨期完工的技术承包、技术服务、接受委托科研等合同，检查是否采用完工百分比法，确认收入。

　　确认高新技术产品（服务）收入的确认方法：是否与财务报表所采用的收入确认方法一致，是否符合适用的会计准则和相关会计制度的规定。

　　对研发费用进行结构性分析：判断其合理性，做出相应记录。特别关注人员人工的费用核算是否合理，以及直接投入的研发支出、管理费用、原材料明细账等，确认结转研发费用的合理性和金额的准确性。

　　关注无形资产的真实性及摊销金额的准确性：高新技术企业的核心竞争力往往依赖于知识产权，因此无形资产的真实性和准确性至关重要。

　　理解企业业务模式及技术特点：高新技术企业的业务模式和技术特点通常与传统企业不同，因此莆田高新专项审计师需要充分理解这些特点，以便更好地把握企业的运营情况和资产负债表的真实状况。

　　关注知识产权情况：高新技术企业的核心竞争力往往依赖于知识产权，因此审计师需要重点关注企业的商标权、著作权等，并对不同类型的资产进行正确的分类和计量。

　　关注财务风险：高新技术企业的财务风险往往比较大，因此审计师需要重点关注企业的财务状况，并及时报告可能存在的风险。

　　关注应税项目：在高新技术企业的审计工作中，还需要重点关注企业的应税项目，确保相关税务处理的合规性。

　　以上就是在莆田高新专项审计条件中特别要注意的几个方面。审计师在进行高新专项审计时，应全面考虑这些因素，以确保审计工作的准确性和有效性。